Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms