Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD3P84022 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms