Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK-24P63145 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms