Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms