Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS3AP61247 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms