Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSWP56202 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSWP56202 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSWP56202 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSWP56202 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSWP56202 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSWP56202 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSWP56202 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSWP56202 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSWP56202 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSWP56202 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSWP56202 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSWP56202 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSWP56202 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTSWP56202 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTSWP56202 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSWP56202 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSWP56202 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSWP56202 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms