Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms