Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms