Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES1P49788 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES1P49788 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES1P49788 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES1P49788 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES1P49788 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES1P49788 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES1P49788 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms