Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms