Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLCP48506 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLCP48506 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GCLCP48506 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLCP48506 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLCP48506 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLCP48506 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms