Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms