Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL35P42766 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL35P42766 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL35P42766 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms