Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPOP42166 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPOP42166 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPOP42166 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPOP42166 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPOP42166 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPOP42166 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPOP42166 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPOP42166 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPOP42166 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPOP42166 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPOP42166 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPOP42166 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPOP42166 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPOP42166 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPOP42166 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms