Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF9P41273 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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