Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNCAP37840 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNCAP37840 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNCAP37840 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNCAP37840 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNCAP37840 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNCAP37840 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCAP37840 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms