Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGFBR1P36897 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms