Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms