Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL3P36405 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL3P36405 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL3P36405 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL3P36405 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL3P36405 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL3P36405 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARL3P36405 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARL3P36405 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARL3P36405 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARL3P36405 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARL3P36405 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARL3P36405 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARL3P36405 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARL3P36405 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARL3P36405 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL3P36405 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL3P36405 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL3P36405 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL3P36405 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ARL3P36405 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms