Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPB2P35606 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB2P35606 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB2P35606 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB2P35606 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPB2P35606 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPB2P35606 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COPB2P35606 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COPB2P35606 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPB2P35606 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms