Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF2P35227 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms