Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP2C19P33261 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP2C19P33261 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms