Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA11P31270 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms