Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGFR3P22607 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGFR3P22607 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGFR3P22607 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGFR3P22607 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGFR3P22607 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGFR3P22607 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGFR3P22607 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FGFR3P22607 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms