Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFNA1P20827 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms