Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD33P20138 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD33P20138 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD33P20138 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD33P20138 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD33P20138 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD33P20138 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD33P20138 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD33P20138 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD33P20138 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD33P20138 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD33P20138 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms