Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR1P18146 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR1P18146 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR1P18146 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR1P18146 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms