Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTPS1P17812 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTPS1P17812 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms