Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms