Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms