Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRG2P13727 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRG2P13727 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRG2P13727 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRG2P13727 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRG2P13727 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRG2P13727 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRG2P13727 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRG2P13727 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRG2P13727 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRG2P13727 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRG2P13727 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRG2P13727 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRG2P13727 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRG2P13727 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRG2P13727 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRG2P13727 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRG2P13727 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRG2P13727 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRG2P13727 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRG2P13727 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRG2P13727 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRG2P13727 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms