Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM10L2AP0DMW4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM10L2AP0DMW4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms