Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRR29P0C7W0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR29P0C7W0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms