Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNB1P01574 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms