Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLIT2O94813 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLIT2O94813 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLIT2O94813 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLIT2O94813 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLIT2O94813 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLIT2O94813 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SLIT2O94813 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLIT2O94813 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLIT2O94813 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLIT2O94813 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLIT2O94813 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLIT2O94813 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms