Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX15O60248 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX15O60248 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOX15O60248 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOX15O60248 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX15O60248 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms