Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX6O43752 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX6O43752 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX6O43752 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX6O43752 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX6O43752 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX6O43752 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX6O43752 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms