Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms