Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms