Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms