Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPBD1B2RD01 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms