Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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USP27XA6NNY8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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USP27XA6NNY8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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USP27XA6NNY8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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USP27XA6NNY8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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USP27XA6NNY8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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USP27XA6NNY8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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USP27XA6NNY8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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