Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 TTTY8B-201ENST00000328819 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 TTTY8-201ENST00000329684 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 BPHL-202ENST00000380375 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RNU1-28P-201ENST00000383861 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RNU1-27P-201ENST00000383869 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RNU1-1-201ENST00000383925 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RNVU1-18-201ENST00000384010 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RNU1-2-201ENST00000384278 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RNU1-4-201ENST00000384659 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RNU1-3-201ENST00000384782 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 BRCC3-206ENST00000399042 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AP002761.1-201ENST00000400985 262 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 GEMIN6-203ENST00000409566 834 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RPSAP21-201ENST00000414293 885 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC112493.1-202ENST00000436019 673 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AP000266.1-201ENST00000450936 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RN7SL291P-201ENST00000487916 289 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 FAM107B-228ENST00000496330 697 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 MSRA-205ENST00000518255 674 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC008619.1-201ENST00000524312 567 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AL022318.2-201ENST00000558766 258 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AP005202.3-201ENST00000582033 567 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC005176.1-203ENST00000597077 532 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 LINC02532-210ENST00000606430 584 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 U1.40-201ENST00000610976 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC104237.3-201ENST00000611809 427 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 U3.50-201ENST00000611947 228 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 U1.27-201ENST00000615842 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.175-201ENST00000619837 250 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 BRCC3-210ENST00000630295 954 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RNASE9-207ENST00000555230 2668 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 PACRG-AS2-201ENST00000418665 1300 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 NPC2-201ENST00000238633 796 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 KRTAP22-1-201ENST00000334680 296 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 FXYD1-201ENST00000351325 592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 TMEM254-203ENST00000372275 860 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AL590617.1-201ENST00000405630 748 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 SNRK-AS1-201ENST00000422681 750 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 CHCHD4P2-201ENST00000431135 420 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 UBE2Q1-AS1-201ENST00000441613 432 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AC244021.2-201ENST00000445260 529 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NBR1Q14596 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms