Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 ARNT2-207ENST00000533983 6690 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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TCOF1Q13428 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
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TCOF1Q13428 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TCOF1Q13428 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TCOF1Q13428 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TCOF1Q13428 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TCOF1Q13428 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TCOF1Q13428 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TCOF1Q13428 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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