Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016924.1-201ENST00000511512 501 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGHVII-78-1-201ENST00000521105 269 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087379.2-201ENST00000532242 471 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF970P-201ENST00000547456 223 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004224.2-201ENST00000574423 529 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004702.1-201ENST00000580225 195 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC069061.1-201ENST00000580677 397 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073254.1-213ENST00000596622 704 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073254.1-211ENST00000598700 761 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003419.3-201ENST00000613900 527 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012486.1-201ENST00000625143 216 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRSS2-205ENST00000632998 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARVA-201ENST00000334956 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCIN-201ENST00000335119 1941 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOL10-202ENST00000381685 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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KRTAP9-4Q9BYQ2 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 MINDY3-201ENST00000277632 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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KRTAP9-4Q9BYQ2 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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KRTAP9-4Q9BYQ2 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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KRTAP9-4Q9BYQ2 TBC1D28-202ENST00000405044 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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KRTAP9-4Q9BYQ2 RASGRP1-206ENST00000558164 1757 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PKD2L2-201ENST00000290431 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCSK1-202ENST00000508626 2234 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108058.1-201ENST00000457290 2044 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A19-210ENST00000580994 1554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARGP1-201ENST00000417555 2286 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 IRF5-208ENST00000473745 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PATJ-215ENST00000635137 2298 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011487.2-202ENST00000599707 1356 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF583-201ENST00000291598 2538 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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