Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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