Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ITIH6-201ENST00000218436 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC073065.1-201ENST00000411678 2866 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SIPA1L2-203ENST00000366630 6690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MTR-205ENST00000535889 10405 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BHLHB9-202ENST00000372735 5130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BHLHB9-205ENST00000457056 4082 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC245014.1-201ENST00000427732 381 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ERICH3-201ENST00000326665 7159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF551-201ENST00000282296 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PTGS1-207ENST00000619306 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ITGA10-204ENST00000539363 4735 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SPIN3-211ENST00000638712 4286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 COL21A1-201ENST00000244728 4339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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