Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HNRNPA1P67-201ENST00000604027 926 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR9K2-201ENST00000305377 1122 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TRAV6-201ENST00000390428 404 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SULT1C4-202ENST00000409309 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 VN1R35P-201ENST00000428102 693 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 EEF1A1P27-201ENST00000429983 1135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC114928.1-201ENST00000446516 415 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AP000619.1-201ENST00000540293 1000 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL117192.1-204ENST00000553485 449 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL358332.1-201ENST00000555649 813 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC129908.1-201ENST00000624553 648 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms