Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC124045.1-201ENST00000606008 1953 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 FCGR3B-209ENST00000614870 1993 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MAGEB16-205ENST00000399992 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CLEC7A-208ENST00000525605 573 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms