Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KIAA1549Q9HCM3 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
KIAA1549Q9HCM3 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms